碱性氨基酸(basic amino acid)指具有两个氨基和一个羧基的氨基酸，在中性pH时具有净正电荷。如赖氨酸、精氨酸、组氨酸。其中赖氨酸属于人体不能合成的八种必需的氨基酸之例，精氨酸为半必需氨基酸。碱性氨基酸在医药上具有很重要的价值，赖氨酸可以治疗营养缺乏症、发育不全及氮平衡失调症，是重要的食品及饲料的强化剂，特别适用于儿童食品的制造。精氨酸与脱氧胆酸制成的复合制剂（明诺芬）是主治梅毒、病毒性黄疸等病的有效药物。组氨酸可用于生产治疗心脏病、贫血、风湿性关节炎和消化道溃疡等的药物。