更新时间：2024-01-15 17:11
1872年2月，海军省根据太政官第62号公告，从兵部省独立出来。当时，军政与军令并未明确分开。大日本帝国宪法实行后，军令由作为日本陆海军大元帅的天皇通过直属机构主管，海军省内主管军令的部分被参谋本部吸收。
1893年，设置了海军军令部作为海军的最高军令机关。海军省成为主管海军政策、军备、人事、教育等事务的机关，以军务局为中心。
海军省是内阁中的一个省，首长为由天皇任命的海军大臣。海军大臣的职责是海军的军政管理，不具有军令权，由现役的海军大将或中将担任。当逢海军裁军会议等重要事务，海军大臣需要长期离开国内时，由内阁总理大臣兼任的临时海军大臣。
1945年11月30日，海军省根据第680号敕令而废除，改为第二复员省。第二复员省于1946年6月被废除，原海军省的财产全部被大藏省（财务省）处理。海军省资料的一部分被日本防卫省和厚生劳动省继承。
海军省的建筑物在东京都千代田区霞关。由约西亚·康德尔设计，于1894年完成。在二战中受到损坏。战后，至1985年完全被拆除。原址上现为农林水产省本部办公楼（中央联合办公楼第1号馆）。
军务局，管理军备、服务、条约、礼仪等所有海军相关制度。
兵备局，1940年11月15日设立。管理动员、战备、生产等战争执行计划。
军需局，1920年10月1日设立。管理装备研制、燃料、军需等。
人事局，1900年5月20日由海军大臣官房人事课扩张而来。管理军人和文职人员的人事和保障。
教育局，1923年4月1日由外设机构海军教育本部缩编而来。管理海军军人的教育和对国民的宣传活动。
调度局（经理局），负责预算、决算的计划和执行，物资筹措，管理资金和贵重物品。
医务局，负责医疗研究和卫生管理。
法务局，负责维持海军军人的军纪，管理军法会议。
（直接隶属于海军大臣的机构）
海军将官会议
海军技术会议
海军舰政本部，1900年5月20日设立。管理舰船、兵器的开发、生产计划。
海军航空本部，1927年4月5日设立。管理航空器、航空技术的开发、生产、教育计划。
水路部，负责海图制作、海洋测量和海象气象天体的观测。
海军高等军法会议
海军东京军法会议
海军大学校
海军兵学校
海军机关学校，1944年废止。
海军経理学校
海军军医学校
潜水艇部
特攻部
电波本部，1944年4月20日由技术研究所扩张而来。负责雷达和无线电事务。
施设本部，1941年8月1日由内设机构建筑部扩张而来。负责海军设施的设计和工事事务。
化兵战部，即防化部。
运输本部，1943年6月25日由运输部扩张而来。
紧急战备促进部
船舶救难本部，1944年12月30日设立。负责沉没、损伤船只的补充、修理计划以及船员救难。
练习联合航空总队