幼年被认定为前世班禅转世灵童。

1663年，扎寺苏本堪布罗桑丹增拟认定后藏托布甲溪卡出仓村索南旺扎之子为转世灵童，派人报告五世达赖未予肯定，只叫对幼童妥加保护。次年，扎寺将该幼童接入托布甲寺供养。1665年达赖要求扎寺对幼童进行仔细考察。扎寺前后派出三批人员，经过遗物验证，扎寺一致公认该幼童为班禅转世灵童，并派人向五世达赖报告，达赖表示承认，指示将灵童迎入扎寺坐床。1668年正月初三举行坐床典礼，继任为五世班禅。同年10月，清圣祖派人到扎寺祝贺。

清康熙五十二年（1713）康熙帝封五世班禅为“班禅额尔德尼”。清圣祖谕理藩院：“著照封达赖喇嘛之例，给以金印，封为班禅额尔德尼”。钦差大臣策楞在扎寺宣读的圣旨中称“……班禅呼图克图历代勤勉宗喀巴教，……不趋附横逆之事，每年恭派使臣请安进贡，自始至终，虔诚如一，甚属可嘉。……为保障扎什伦布寺所属寺庙原征赋税，永不为他人侵占，兹封班禅呼图克图为班禅额尔德尼，颁给金册金印”。